Ang pangunahing tauhang babae ng larong F. E. A. R. : Silent Facility - isang opisyal ng rapid response assault team ang inatasang maghanap at mag-neutralize ng isang bagay kung saan may kakaibang transmission. Minsan sa isang linggo, gabi na, nagbo-broadcast siya ng impormasyon tungkol sa mga pagkamatay na magaganap sa susunod na pitong araw. Ang paghahanap ay humantong sa pangunahing tauhang babae sa pinakamahihirap na lugar ng lungsod, kung saan biglang lumitaw ang mga sundalong may mahusay na kagamitan at sinubukang pigilan ang opisyal. Ipinapahiwatig nito na pinili ng pangunahing tauhang babae ang tamang direksyon at gusto nilang pigilan siya sa anumang paraan. Tulungan siyang labanan ang mga pag-atake at sumulong sa F. E. A. R. : Tahimik na Pasilidad.