Ang bayani ng larong Underwater 2D ay dumating sa isang planeta na ganap na natatakpan ng tubig, talagang walang lupain dito at ang lahat ng buhay ay puro sa ilalim ng tubig. Kailangan mong bumaba sa ibaba at simulan ang paggalugad ng hindi kilalang mga anyo ng buhay. Lumalabas na ang buhay sa ilalim ng dagat ay halos kapareho sa karagatan ng Earth. Gayunpaman, sa mga pamilyar na isda at algae mayroong maraming hindi pamilyar na mga naninirahan. Kinakailangang mahuli ang mga ito upang makapaghatid ng mga sample sa Earth at masusing pag-aralan ang mga ito. Para sa pangangaso, gumamit ng crossbow na may arrow na nakatali sa isang lubid. Ituro ito sa napiling bagay at kunan para makuha ito sa Underwater 2D.
