Isang strategic at pisikal na puzzle ang naghihintay sa iyo sa Bombonauts. Magpapatakbo ka ng mga bomba at kakailanganin mo hindi lamang ang lohika at diskarte, kundi pati na rin ang bilis. Ang mga bomba ay dapat na mailagay nang napakabilis upang hindi ito sumabog sa iyong mga kamay. Ang gawain ay upang ilipat ang mga kahoy na kahon na nasa site. Una, mag-isip ng kaunti, at pagkatapos ay mabilis na ilagay ang mga pampasabog. Magsisimula itong sumabog sa isang segundo lamang. Kung hindi mo makuha ang ninanais na epekto, kakailanganin mong i-replay ang level sa Bombonauts.
