Sa mga kontrabida Bowser ay may bagong kapanig - isang malakas na bruha. Siya magpadala pababa sa Mushroom Kingdom malakas na spell nakaagaw ng araw at inilipat sa palasyo kasama ang prinsesa sa mga taksil lair. Muli kailangan ng tulong Mario at siya napupunta magligtas kagandahan, at para sa isa at i-save ang mundo mula sa walang hanggang kadiliman. Pamahalaan ang mga arrow, tumalon sa mga kaaway, mangolekta ng mga barya nang mas maaga sa labanan sa pangunahing kaaway.
