Upang manalo ang laro Spiderman 3: Pagsagip Mary Jane, kailangan mong bitawan ang batang babae na may pangalang Mary Jane, na nagmula sa mga kamay ng buhong. Spider-Man ay upang lumipat mula sa isang gusali sa ibang at gamitin ang kanilang iba pang mga sobrang kapangyarihan na ay nagbibigay-daan sa kanya upang makakuha ng sa buhong at wasakin ito, kaya iligtas mula sa pagkabihag Jane