Ang zombie virus ay puspusan na sa Mutant Zone: Zombie Merge Fighter. Hindi na posible na maglakad sa kahabaan ng mga lansangan nang hindi nakatagpo ng isang gutom na zombie. Bilang karagdagan, nagsimulang mag-mutate ang undead at mas maraming masasama at mapanganib na nilalang ang lumitaw. Tulungan ang bayani na mabuhay at protektahan ang kanyang sarili mula sa nakamamatay na kagat. Magpapatakbo ka sa isang espesyal na field sa ibaba, pagbili ng kagamitan at armas, pagsasama-sama ng dalawa sa parehong uri upang mapataas ang kanilang antas. Ilipat ang natanggap na item ng damit o armas sa tuktok na linya upang ito ay lumitaw sa bayani at magagamit niya ito sa Mutant Zone: Zombie Merge Fighter.