Ang bayani ng larong Katana Zero: Borrowed Seconds ay si Reya, na matatas sa paghawak ng katana sword. Kasama ang pangunahing tauhang babae, lilipat ka sa mga lansangan ng neon city. Ang layunin ay upang sirain ang mga agresibong dayuhan. Ang mga ito ay hindi mga dayuhan, ngunit mga taong dumating mula sa ibang panahon. Isang sobrang lihim na teknolohiya na nagpapahintulot sa iyo na kontrolin ang oras ay ninakaw mula sa isang lihim na laboratoryo. Ginagamit ito ng mga kontrabida para sa kanilang sariling mga layuning pangkalakal, at ang lungsod ay nagsimulang mapuno ng mga taong marunong lamang pumatay. Tulungan ang pangunahing tauhang babae na makayanan ang gawain ng paghahanap ng mga pangunahing kontrabida at pagharap sa kanilang mga alipores sa Katana Zero: Borrowed Seconds.
