Ang bayani ng larong Escape the Giant School 3D ay biglang naging napakaliit, na natagpuan ang kanyang sarili sa isang paaralan na naging napakalaki para sa kanya. Ang mga ordinaryong libro, lapis at pambura ay naging mga hadlang sa landas ng bata at gusto niyang mabilis na umalis sa paaralan na naging mapanganib. Tulungan siyang malampasan ang mga hadlang sa anyo ng malalaking stationery, aklat-aralin at iba pang mga bagay na karaniwang ginagamit ng isang mag-aaral. Tumalon sa mga pambura at lapis, sa ibabaw ng mga aklat at mga mesa, maabot ang finish line upang lumipat sa isang bagong lokasyon sa Escape the Giant School 3D.
