Isang alien invasion sa Animals vs Zombies ang nagpukaw ng hitsura ng mga zombie. Ang mga hindi inanyayahang bisita mula sa kalawakan ay nagdala sa kanila ng isang virus na nagiging mga buhay na patay. Lumala ang sitwasyon hanggang sa isang kakaibang pangyayari ang naganap. Nagsimula ito sa isang grupo ng mga zombie na kinokontrol ng mga dayuhan na umaatake sa bahay ng isang magsasaka. Ang kanyang aso sa bakuran ay dumating sa pagtatanggol ng may-ari at biglang umatras ang mga zombie. Lumalabas na ang mga alagang hayop ay isang banta sa mga zombie at maging sa mga dayuhan, at nagsimula silang manghuli ng mga hayop at i-lock ang mga ito sa mga kulungan. Sa larong Animals vs Zombies tutulungan mo ang bayani na palayain ang kanyang alagang hayop at labanan ang mga zombie at alien.
