Sa mundo ng neon space, lumalala muli ang sitwasyon sa Neon Space Defender. Ang isa pang armada ng mga dayuhang barko ng pirata ay nais na sakupin ang planeta at itinapon nila ang lahat ng kanilang lakas dito. Kontrolin ang barko habang bumaril sa papalapit na mga bagay. Inaalok ka ng tatlong mga mode ng pagtatanggol at ang kanilang pagkakaiba sa isa't isa ay nasa bilis lamang ng apoy at ang paglapit ng mga bagay ng kaaway. Maaari kang kumuha ng isang perimeter defense, o lumipat sa paligid ng field, pagpili ng pinakamahusay na posisyon, ang tagumpay ay nakasalalay sa iyong pinili sa Neon Space Defender.
