Ang mga arkeologo, mga wire ng paghuhukay, ay hindi sinasadyang nabalisa ang sinaunang virus, na dumating sa lupa mula sa kosmos kasama ang pagbagsak ng meteorite. Ginugol niya ang daan-daang mga katawan sa lupa bilang pag-asahan sa kanyang mga pakpak, at nang masira siya, sinimulan niya ang kanyang itim na dahilan. Ang gawain nito ay upang gawing monsters ang lahat ng mga buhay, at sirain ang mga halaman. Dapat mong tulungan ang bayani sa Seedfall: ipagtanggol ang huling puno na i-save ang huling puno na may mga espesyal na pag-aari. Ang mga buto nito ay mga barya na magpapahintulot sa bayani na makuha ang lahat ng kailangan mo upang lumikha ng mga armas. Makakatulong ito sa paglaban sa mga monsters at i-save kung ano ang hindi pa nawasak sa seedfall: ipagtanggol ang huling puno.
