Gamit ang mga pag-click ng stickman, ang bayani ng larong Stickman Run, tutulungan mo siyang tumakbo at tumalon sa pulang pinto patungo sa susunod na antas. Tatakbo ang stickman hero sa sandaling bigyan mo siya ng utos. Kapag naabot niya ang susunod na balakid, siya ay tatalikod at tatakbo pabalik at tanging pader o sagabal lamang ang makakapigil sa kanya. Upang maiwasan ang walang katapusang pag-backtrack, mag-click sa bayani upang mabilis siyang tumalon sa ibabaw ng bloke o maipasa ang mga susunod na puwang sa pagitan ng mga platform. Ang mga antas ay nagiging mas mahirap. Lalabas ang mga mapanganib na kalaban na maaaring mabigla sa stickman, kaya kailangan mo ring tumalon sa kanila sa Stickman Run.