Ang mga bomba ang iyong sandata upang malutas ang mga problema sa Bomb Master 3D. Sa bawat antas dapat mong sirain ang isang gusaling gawa sa maraming kulay na mga cube. Bukod dito, ang bilang ng mga bomba ay mahigpit na limitado. Makakakita ka ng isang set ng mga ito sa kaliwang sulok sa ibaba. Habang nagpuntirya, may makikita kang kulay abong lugar - ito ang lugar kung saan mahuhulog ang iyong bomba. Ngunit isaalang-alang ang shock wave, ito ay magiging mas malaki ng kaunti, kaya ang mga cube ay masisira. Ito ay kinakailangan upang makamit ang kumpletong pagkawasak ng mga bloke. Kung may natitira kahit isa, mawawala ang level, ngunit maaari mo lang itong i-replay hangga't kinakailangan hanggang sa makumpleto mo ito sa Bomb Master 3D.
