Ang hitsura ng mga super power ay hindi nangangahulugan na ang isang tao ay awtomatikong nagiging isang super hero. Hindi pa rin alam kung paano niya magagamit ang kanyang mga kapangyarihan; Karamihan sa mga super hero ay nakakuha ng kanilang mga kakayahan sa pamamagitan ng ilang uri ng eksperimento o panlabas na impluwensya. Ang pangunahing tauhang babae ng larong Superhero Girl Escape ay may malubhang sakit at sumang-ayon sa isang eksperimento, bilang isang resulta kung saan nakakuha siya ng hindi kapani-paniwalang mga kakayahan at nakuhang muli. Ang departamento ng militar ay naging interesado sa kanya at ang batang babae ay na-hostage nang walang pagkakataon na makalaya. Dapat mong tulungan siyang makatakas sa Superhero Girl Escape.
