Kung susundin mo ang mga pakikipagsapalaran ng isang estudyante ng Mystery School na nagngangalang Phil, alam mong dinukot siya ng isang alien ship. Tiyak na sinubukan mong tulungan siya. Gayunpaman, ang lahat ay naging hindi masama. Ang bayani ay naging kapaki-pakinabang sa mga tripulante ng dayuhan na barko at mabilis na sumali sa koponan. Sa laro ng Riddle Transfer makikilala mo siya at ang kanyang mga bagong kaibigan. Patungo lang sa Earth ang barko, ngunit biglang nawala ang kontrol, may kumokontrol sa barko mula sa labas at puwersahang inilapag ito sa isa sa mga lihim na base. Inalis ng mga lalaking nakaitim na may mga armas ang lahat ng pasahero ng barko at inilagay ang bawat isa sa isang hiwalay na silid. Tutulungan mo si Phil sa Riddle Transfer, at matutulungan niya ang iba.
