Ang isang ninja ay naglalaan ng ilang oras araw-araw sa pagsasanay, at ito ay kinakailangan upang hindi mawalan ng hugis at hindi mawalan ng mukha sa isang kritikal na sandali. Ang bayani ng larong Jungle Runner ay isang dalubhasa at may karanasan na mandirigma, ngunit ang kanyang pagsasanay ay hindi na nasiyahan sa kanya, ito ay napakadali sa kanya, na nangangahulugang hindi siya umuunlad. Samakatuwid, ang bayani ay nagpasya na pumunta sa gubat at gawin ang isang vertical run sa pamamagitan ng mga puno. Ang bayani ay nagmamadaling pataas nang may kamangha-manghang bilis, at ang iyong gawain ay tiyaking hindi siya makakabangga ng anuman o sinuman. Lumalabas na hindi nag-iisa ang ating ninja sa gubat, bukod pa rito, susubukang pigilan siya ng mga mutant bees sa Jungle Runner.
