Ang paglipat ng ibon ay ang taunang paglipat ng mga ibon sa mas maiinit na rehiyon. Sa sandaling dumating ang taglagas, maraming species ng ibon ang patungo sa timog upang makaligtas sa malamig na taglamig. Ang mga duck ay isa sa kanila, at sa laro ay tutulungan mo ang isang pato na malampasan ang isang mahirap na paglipad. Ngunit kailangan mo munang pumili ng isang karakter mula sa mga bayani na ipinakita sa laro: Pam, Mac, Uncle Dan, Gwen at Dax. Sinuman sa kanila ay susunod sa iyong kontrol. Ang balangkas ng Migration Flappy Duck ay ang iyong ibon ay nahulog sa likod ng kawan. Nang lumipad ang lahat ng kanyang mga kamag-anak, nasira ang kanyang pakpak, ngunit ngayon ay gumaling na ito at maaari mong subukang abutin ang kawan at lumipad nang magkasama. Ngunit kailangan mo munang malampasan ang maraming mga hadlang at i-flap ang iyong mga pakpak nang masigla nang walang pahinga sa Migration Flappy Duck.
