Ang isang ninja ay dapat magsanay nang regular upang manatili sa hugis. Sa larong Math Quest makikita mo ang bayani sa mga bamboo platform. Nakatayo siya at hindi gumagalaw. Hanggang sa malutas mo ang halimbawa ng matematika. Sa katunayan, ito ay nalutas na, ngunit kailangan mong suriin ito at mag-click sa naaangkop na pindutan: pula - maling sagot, berde - tama. Hindi mo na kailangang mag-isip nang matagal; may time scale sa ibaba. Kung wala kang oras para sumagot, magtatapos ang laro. Ang Math Quest ay may tatlong mga mode ng kahirapan. Sa pinakamadaling isa ay dadaan ka sa sampung antas, sa average na isa labinlima, at sa mahirap na tatlumpung antas.
