Noong unang panahon, ang mga tao ay walang iisang diyos; naniniwala sila sa iba't ibang mga diyos, na bawat isa ay may pananagutan sa kanilang sariling direksyon. Ang mga kaganapan ng larong Pyramid Puzzle ay nagaganap sa sinaunang Egypt sa panahon ng maalamat na Reyna Cleopatra. Nais niyang malaman kung paano nagkaroon ng mga espesyal na kakayahan ang kamakailang namatay na pharaoh at kung ang dakilang diyos na si Ra ay kasangkot dito. Ipinadala ng reyna ang kanyang tapat na katulong na si Hanna upang matuklasan ang mga lihim ng pharaoh, ngunit para magawa ito kailangan niyang tumagos sa loob ng pyramid at kahit na bisitahin ang mga lihim na silid, ang pasukan kung saan sarado sa mga tagalabas. Tulungan ang batang babae na kumpletuhin ang gawain. Ang reyna ay naghihintay para sa mga resulta at hindi magiging masaya kung wala sila sa Pyramid Puzzle.
