Ang pangunahing tauhang babae ng larong Run Healthy ay nakakaramdam ng pagod at pag-ubo, na malinaw na nagpapahiwatig ng simula ng isang sipon. Upang maiwasan ang karamdaman mula sa pagbuo sa mas malubhang kahihinatnan, dapat itong sirain sa ugat. Dahil dito, magsisimula na ang tinatawag na healthy jogging. Habang tumatakbo nang basta-basta, gabayan ang pangunahing tauhang babae upang mangolekta ng masustansyang pagkain at maiwasan ang mga mamantika na burger. Ang sukat sa itaas ng ulo ng batang babae ay dapat na mapunan upang mabigyan sila ng isang karapat-dapat na pagtanggi kapag nakatagpo ng mga virus. Sa linya ng pagtatapos kailangan mong dumaan sa ilang mga ehersisyo machine: isang gilingang pinepedalan, pag-angat ng barbell, atbp. Ang lahat ng ito ay upang mapabuti ang kalusugan. Bilang resulta, ang batang babae ay magiging masayahin at ganap na malusog sa Run Healthy.
