Ang pinaka-iba't ibang mga uniberso, isa-isa, ay nakunan ng mga halimaw na Skibidi toilet. Mahigpit na sinundan ni Mario ang mga balita at nauunawaan na maya-maya ay makakarating sila sa Kaharian ng Mushroom. Nagpasya siyang pigilan ito at pumunta sa mga nahuli na mundo upang sirain ang mga kontrabida doon. Napagpasyahan niya ito para sa isang kadahilanan, ang aming bayani ay nagsilbi sa katalinuhan sa loob ng mahabang panahon, bagaman kakaunti ang nakakaalam tungkol dito, at mayroon ng lahat ng kinakailangang mga kasanayan. Matatagpuan ng bayani ang kanyang sarili sa teritoryo na nakuha ng mga halimaw ng Skibidi. Ang isang tubero na may mga kasanayan sa espiya ay dapat mag-scout sa lugar at subukang gawing tahimik ang lahat hangga't maaari. Gayunpaman, hindi makakamit ang kumpletong katahimikan. Kontrolin ang kanyang paggalaw gamit ang mga arrow. Sa paraan magkakaroon ng mga obstacles na kailangan mong tumalon. Ang mga banggaan ay hindi maiiwasan at ito ay nagkakahalaga ng paghahanda para sa kanila nang maaga upang pag-atake mula sa pinaka-maginhawang posisyon. Ang sa iyo ay hindi makakagamit ng mga armas, dahil ang malakas na mga pag-shot ay makakaakit ng hindi kinakailangang atensyon sa kanyang tao. Makisali sa kamay-sa-kamay na pakikipaglaban sa kalaban, hampasin gamit ang Z key at sumulong sa Super Spy Mario VS Skibidi Toilet. Ang bawat nakumpletong antas ay gagantimpalaan at magagawa mong palakasin ang Mario.
