Walang sinuman ang tumututol sa mga nagawa ng Teenage Mutant Ninja Turtles at ng Power Rangers, gayunpaman, hindi sila magkasundo sa isa't isa at ang bawat grupo ay nag-aangkin na sila ay nakatataas. Upang malaman kung sino ang pinakamahusay, nagpasya ang mga bayani na ayusin ang mga laban sa kanilang sarili at magsisimula sila sa sandaling makapasok ka sa larong Teenage Mutant Ninja Turtles VS Power Rangers: Ultimate Hero Clash. Pipiliin mo ang mga manlalaban na unang papasok sa arena. Pagkatapos ng isang serye ng mga laban, isang panalo na lang ang dapat manatili. Walang nag-oobliga sa iyo na mag-root para sa isang tao, pipili ka ng isang bayani para sa iyong sarili at ipo-promote ito, na tumutulong na talunin ang lahat ng mga karibal sa Teenage Mutant Ninja Turtles VS Power Rangers: Ultimate Hero Clash.
