Sa Ben 10: Brains vs Bugs kailangan mong tulungan ang isang nakakatawang berdeng dayuhan na palayain ang kanyang mga inagaw na kaibigan. Sa harap mo, makikita ang iyong karakter sa screen, na makikita sa isang partikular na lokasyon. Gamit ang mga control key gagabayan mo ang kanyang mga aksyon. Ang iyong bayani ay kailangang maglakad sa isang tiyak na ruta, pagtagumpayan ang iba't ibang mga bitag at iba pang mga panganib. Sa daan, mangolekta siya ng mga gintong barya at iba pang kapaki-pakinabang na mga item na magdadala sa iyo ng mga puntos sa larong Ben 10: Brains vs Bugs at maaaring magbigay sa karakter ng iba't ibang uri ng mga bonus. Gayundin, ang iyong karakter ay kailangang labanan ang mga bug na darating sa kanyang paraan.
