Kahit na ang pinakamalakas na mandirigma ay minsang nakipagtagpo sa isang mas malakas pa at pagkatapos ay kailangan niyang tumakas at ito ay hindi kaduwagan, kundi isang pansamantalang pag-urong upang makaipon ng lakas at makapaghiganti. Sa larong Run Ninja Run tutulungan mo ang bayani na natalo sa isang tunggalian na may napakalakas na kalaban. Tinalian ng nanalo ang bihag at umupo upang magpahinga at mag-isip kung ano ang susunod na gagawin sa kanya. At habang nag-iisip, nakatakas ang ating bida. Ngayon ang lahat ay nakasalalay sa kanyang liksi at iyong kagalingan ng kamay. Ang bayani ay may sapat na lakas upang tumakbo ng mabilis, at gagawin mo siyang tumalon, magsisiksikan sa makitid na lugar at sirain ang mga bakod sa pagtalon gamit ang isang sipa sa Run Ninja Run.
