Sa sandaling lumitaw ang mga hindi gustong personalidad sa ating virtual na lungsod na pumipinsala sa lungsod at sa mga naninirahan dito, ang mga taong-bayan ay nagsimulang pumili ng isang bayani na maaaring labanan ang mga kontrabida. Sa pagkakataong ito, lumitaw sa mga lansangan ng lungsod ang mga halimaw mula sa Monster Association, na nilikha bilang pagsuway sa Hero Association. Tanging si Saitama o Bald Cloak, aka One Punch Man o One Punch Man, ang makakaharap sa kanila. Ngunit kailangan mo siyang tulungan sa One Punch Man 3D Game, dahil magkakaroon ng maraming kalaban at kailangan mo munang hanapin sila sa isang malaking lungsod. Sa kanang bahagi sa itaas ay makikita mo ang isang navigator na may mga pulang tuldok dito - ito ang mga layunin ng bayani sa One Punch Man 3D Game.
