Dadalhin ka ng larong Nano War sa panloob na mundo ng mga cell. Isang kasawian ang nangyari doon - ang mother cell ay inatake ng mga virus at nagsimulang gumawa ng mga nahawaang cell. Ang isang pares ng mga malulusog na selula ay nagpasya na ipaglaban ang kanilang ina at hilingin sa iyo na tulungan sila dito. Kumuha ng maikling kurso para matutunan kung paano magpatuloy. Isaalang-alang ang antas ng lakas, ito ay ipinahiwatig ng mga numerong halaga at idirekta ang mga cell upang masakop ang espasyo. Simulan ang pagkuha ng mga neutral na gray na cell upang unti-unting madagdagan ang iyong hukbo sa Nano War, patungo sa tagumpay at pagpapagaling ng buong organismo. Magsisimula ka sa tiyan.