Ang mouse sa laro ng Mouse Master ay hindi masyadong hangal, alam niya na ang libreng keso ay nasa bitag lamang ng daga, ngunit hindi niya maaaring tanggihan ang isang malaking piraso na namamalagi nang hiwalay sa gilid. Upang makarating dito, kailangan mong dumaan sa mga nakalagay na mousetraps. Sa magkahiwalay na antas ay isasaayos sila sa anyo ng isang labirint. Maingat na gabayan ang mouse upang hindi ito matamaan ng anumang mousetrap, at kapag kinuha mo ang isang piraso ng keso, kailangan mong bumalik at ito ay isang kahihiyan kung mahuli ka. Sa mga susunod na antas, lilitaw ang isang pusa, mabuti, paano kung wala ito, at ito ay isang mas kakila-kilabot na kaaway at mas mapanganib kaysa sa bitag ng daga sa Mouse Master.