Ang isang matapang na ninja na nagngangalang Kyoto ay dapat umakyat sa bubong ng isang mataas na gusali. Ikaw sa larong Ninja Up ay makakatulong sa karakter sa pakikipagsapalaran na ito. Sa harap mo, makikita sa screen ang iyong ninja na nakatayo sa lupa. Sa isang senyales, ang iyong karakter ay magsisimulang tumalon sa isang tiyak na taas. Kakailanganin mong gumuhit ng linya sa ilalim ng ninja gamit ang mouse. Sa sandaling iguhit mo ito, isang espesyal na lubid na goma ang lilitaw. Ang iyong bayani, na nahulog dito, ay gagawa ng isang pagtalon at lilipad. Kaya sa pamamagitan ng pagguhit ng mga lubid na ito sa larong Ninja Up, unti-unti mong tutulungan ang bayani na umakyat sa bubong ng gusali. Kasabay nito, sa kahabaan ng paraan, kakailanganin mong tulungan ang ninja na mangolekta ng mga item na mag-hang sa hangin sa iba't ibang lugar sa larangan ng paglalaro. Para sa kanilang pagpili sa laro Ninja Up ay magbibigay sa iyo ng mga puntos.
