Ang pangunahing tauhang babae ng larong Miss Yuuno 2, isang batang babae na nagngangalang Yuno ay nawala ang kanyang memorya at, na sinubukan ang iba't ibang paraan upang maibalik siya, ay bumaling sa mistisismo. Itinuro siya ng mangkukulam sa mga anino na halimaw pagkatapos noon. Habang binisita niya ang mas mababang mundo at nalampasan ang lahat ng antas, nagsimulang dahan-dahang bumalik ang alaala. Ngunit hindi sapat ang isang kampanya, kailangan mo pa ring ipagsapalaran ang iyong kalusugan at bisitahin muli ang teritoryo ng mga itim na halimaw. Sa pagkakataong ito ay naghanda sila para sa seryoso at nagdagdag ng bago, mas kakila-kilabot na mga bitag at sila mismo ay susubukan na huwag makaligtaan ang batang babae. Tulungan siyang kolektahin ang lahat ng mga tala sa laro, makakatulong ito sa kanyang ganap na pagbawi sa Miss Yuuno 2.
