Ang mga naninirahan sa isang maliit na nayon ng Hapon ay patuloy na inaapi ng lokal na aristokrata. Nagpasya ang isang samurai na naglalakbay sa Japan na tulungan sila. Upang gawin ito, kakailanganin niyang pasukin ang ari-arian ng isang aristokrata at sirain ito. Ikaw sa larong Mini Samurai Kurofune ay tutulong sa samurai sa pakikipagsapalaran na ito. Ang iyong bayani ay kailangang makapasok sa estate na binabantayan ng mga mersenaryo ng ninja. Aatakehin nila ang iyong karakter. Kinokontrol mo ang mga aksyon ng bayani na lalaban sa kanila. Deftly wielding a sword at gamit ang hand-to-hand combat techniques, kailangan mong sirain ang lahat ng iyong mga kalaban. Para dito sa larong Mini Samurai Kurofune bibigyan ka ng mga puntos. Matapos ang pagkamatay ng kaaway, mangolekta ng mga tropeo na mahuhulog sa kanya.
