Sa pagtatanggol, tulad ng sa opensiba, lahat ng paraan ay mabuti at higit sa hindi pangkaraniwang mga aksyon. Ang mas maraming pagkakataon na manalo kahit na may maliit na bilang ng mga tropa. Sa larong Stack Defense tutulungan mo ang iyong asul na karakter na ipagtanggol ang sarili. Upang gawin ito, kailangan niyang lumipat nang napakabilis, nangongolekta ng mga stack. Kailangan ang mga ito upang tapusin ang pagbuo at pagbutihin ang iyong defense tower sa lahat ng posibleng paraan. Isalansan ang iyong mga bayani sa likod mo, pagkatapos ay pumunta sa iyong tore at i-load ang lahat, punan ang gauge sa itaas ng gusali. Lalago ang mga pader at tataas ang bilang ng mga mamamana, na magsisimulang bumaril sa iyong kalaban na nangahas na lumapit sa tore sa Stack Defense.