Isang malisyosong Hacker ang lumitaw sa mundo ng Cybernetic, na gustong sirain ang lahat sa paligid. Ikaw sa larong Cyberchase Quest 1: Motherboard ay kailangang i-neutralize ito. Sa simula ng laro, pupunta ka sa isang espesyal na laboratoryo kung saan gagawa ka ng isang karakter para sa iyong sarili, na bibigyan ng ilang mga kakayahan. Pagkatapos nito, makikita mo ang bida sa iyong harapan. Bibigyan ka ng mga gawain ng isang robot na babae. Lahat ng mga ito ay mauugnay sa paghahanap para sa Hacker. Kailangan mong kumpletuhin ang mga quest na ito. Kadalasan, upang makumpleto ang susunod na gawain, kakailanganin mong lutasin ang isang tiyak na palaisipan o rebus. Sa sandaling makumpleto ang lahat ng mga pakikipagsapalaran, magagawa mong i-neutralize ang Hacker at iligtas ang mundong ito sa Cyberchase Quest 1: Motherboard game.
