Ang bayani ng larong Tomb Runner online 3D ay nakahanap ng isang sinaunang templo sa gubat, at mayroong isang malaking asul na brilyante sa loob nito. Ngunit pagkakuha niya ay yumanig ang lupa at may narinig na kalampag. Ito ay isang grupo ng mga katutubo na nagbabantay sa templo at sa kayamanan nito sa loob ng maraming siglo. Hahabulin nila ang mangangaso, at tutulungan mo siyang makatakas. Una, kailangan niyang humiwalay sa galit na galit na mga katutubo at para dito kailangan niyang tumakbo sa isang disenteng distansya. Idirekta siya sa landas na bato, lampasan ang mga mapanganib na voids, kung saan kailangan mong tumalon sa pamamagitan ng pagkontrol sa mga arrow o pagtapik sa screen. Kapag tumakas ang bayani sa isang disenteng distansya, lalabas ang tulong sa anyo ng isang helicopter at sisirain mo ang lahat ng humahabol sa Tomb Runner online 3D.
