Hindi sapat ang mga problema para kay Sonic kay Dr. Robotnik, na naghahanap ng hedgehog sa buong mundo, gayundin ang maraming kulay na mga bula ay nagpasya na atakihin ang mahirap na kapwa nang walang dahilan, walang dahilan. Ngunit alisin ito, maaari mong maunawaan ang larong Bubble Shooter at sa gayon ay gawing mas madali ang gawain ni Sonic. Upang hindi siya magambala sa mga bagay na walang kabuluhan. Sa bawat antas, alisin ang mga bola sa pamamagitan ng pagbaril sa kanila. Kung mayroong tatlo o higit pang mga bula ng parehong kulay sa malapit, sila ay sasabog at mawawala. Sa bawat hindi matagumpay na shot, unti-unting mahuhulog ang isang grupo ng mga bola, na nagpapalipat-lipat ng mga hilera at magpapahirap sa iyo na sirain ang mga ito sa Bubble Shooter.
