Isang umaga, nagising si Mario sa katotohanang may pumipigil sa kanya sa paghiga sa kanyang likod. Sa paghahanap ng ilang mga paglaki, siya ay medyo natakot at agad na natauhan mula sa takot at tumakbo sa salamin upang tumingin. Ano ang lumitaw sa likod nito. Nang makita ang maliliit na pakpak, ang bayani ay nabigla at kahit noong una ay nabalisa sa Flappy Mario. Ngunit pagkatapos, sa pagmuni-muni, napagpasyahan niya na ang kakayahang lumipad ay magbibigay sa kanya ng maraming pakinabang. Hindi na niya kailangang pangalagaan ang transportasyon, maaari niyang malampasan ang landas sa himpapawid nang mas mabilis kaysa sa isang motorsiklo o kotse. Ito ay nananatiling lamang upang malaman kung paano lumipad at tutulungan mo siya sa pamamagitan ng pagpasok sa laro ng Flappy Mario.
