Ang matapang na ninja ng Kyoto, sa mga tagubilin ng pinuno ng kanyang order, ay dapat pumunta sa Dark Lands at maghanap ng mga sinaunang artifact doon. Ikaw sa larong Ninja vs Zombies ay sasama sa kanya sa pakikipagsapalaran na ito. Ang iyong bayani ay kailangang dumaan sa maraming lokasyon at malampasan ang iba't ibang panganib. Ang mga sangkawan ng mga zombie ay gumagala sa mga lokasyon kung saan kailangang labanan ng iyong bayani. Sa pagpasok sa labanan sa kanila, ang bayani ay gagamit ng iba't ibang armas. Sa pamamagitan ng pagsira sa buhay na patay, makakakuha ka ng mga puntos, at maaari ka ring mangolekta ng mga tropeo na mahuhulog sa kanila. Sa mga puntos na nakuha mo, maaari kang bumili ng iba't ibang mga armas at bala para sa iyong karakter sa tindahan ng laro.
