Sa kaibuturan ng gubat ay nakatira ang isang bakulaw na nagngangalang Donkey na laging tumutulong sa kanyang mga kaibigan. Minsan ay nagpasya ang aming karakter na puntahan ang kanyang malalayong kamag-anak na nakatira sa kabilang bahagi ng gubat. Ikaw sa larong Super Donkey Kong 99 ay kailangang tulungan ang bayani sa pakikipagsapalaran na ito. Ang iyong karakter ay makikita sa screen sa harap mo, na, sa ilalim ng iyong paggabay, ay susulong sa landas, unti-unting tumataas ang bilis. Sa daan, ang iyong karakter ay kailangang mangolekta ng mga saging at gintong barya na nakakalat sa lahat ng dako. Kakailanganin din niyang malampasan ang iba't ibang mga bitag at mga hadlang na darating sa kanyang paraan.
