Ang bayani ng City Run 3D ay isang katutubong mamamayan. Siya ay gumagalaw sa paligid ng lungsod sa pamamagitan ng kotse, nakaupo sa bahay na nanonood ng TV at sa pangkalahatan ay hindi gumagalaw. Hindi nagtagal ay napansin niyang tumataas ang kanyang timbang. Naging mas mahirap para sa kanya ang umakyat sa hagdan at sa pangkalahatan ay nagsimulang lumala ang kanyang kalusugan. Medyo natakot nito ang bayani at nagpasya siyang pumasok para sa sports, pinili ang pagtakbo. Sa umaga ay tumakbo siya, at hinihiling niya sa iyo na tulungan siyang tumugon sa iba't ibang mga hadlang. Sa kalsada kung saan siya ay tatakbo, kotse drive, may mga iba't-ibang mga obstacles sa ilalim kung saan kailangan mong yumuko. Mangolekta ng mga barya sa pamamagitan ng pagkontrol sa mga WASD key. Tulungan ang bayani na tumakbo hangga't maaari sa City Run 3D.
