Kabilang sa mga mikrobyo, ang mundo na kung saan ay malaki at hindi lubos na nauunawaan, mayroong parehong nakakapinsala at kahit na mapanganib, at kapaki-pakinabang, kung wala ang tao at iba pang nabubuhay na bagay ay hindi magagawa. Sa Avoid The Germs, tutulungan mo ang isang maliit na microbe na kulay lemon para mabuhay sa isang mapanganib na mundo. Sinusubukan niyang linisin ang katawan ng mga labi hangga't maaari, ngunit sa yugtong ito kailangan niya ng tulong, dahil lumitaw ang masasamang malalaking pulang mikrobyo. Hahabulin nila ang bata, sinusubukang lamunin ang kawawang kapwa, at depende sa iyo kung gaano siya tatagal sa Avoid The Germs.
