Upang maging isang tunay na ninja, kailangan mong dumaan sa maraming mahirap at kung minsan ay mapanganib na mga pagsubok, kapwa sa panahon ng pagsasanay at pagkatapos nito. Ang bayani ng larong Ninja the Jump ay bata pa at walang karanasan, kamakailan lamang ay natapos niya ang kanyang pag-aaral sa isa sa mga monasteryo ng Tibet at ngayon siya ay naiwan sa kanyang sariling mga aparato at dapat mahanap ang kanyang paraan. Nauna na lang siya para sa suwerte at dinala siya ng kalsada sa isang medyo delikadong lugar. Binubuo ito ng marshy swamp na may mga kahoy na tuod na lumalabas sa kanila. Sa pamamagitan lamang ng pagtalon sa mga ito maaari kang lumipat sa isang tuyo at ligtas na lugar. Sa kaliwa ay makikita mo ang isang maikling dilaw na sukat. Mag-click sa bayani at magsisimula siyang lumaki ang haba. Kung mas matagal mong pinindot, mas mahaba ang sukat at mas malayo ang pagtalon. Kalkulahin ang tamang haba upang hindi makaligtaan ang bayani sa Ninja the Jump.
