Ang isang pangkat ng mga dayuhan ay dumating sa ating planeta mula sa kailaliman ng espasyo upang mangolekta ng mga sample at magnakaw ng mga hayop at tao para sa mga eksperimento. Ikaw sa larong Aliens Vs Math ay magliligtas ng mga tao at hayop mula sa pagkabihag. Sa harap mo sa screen ay magkakaroon ng pag-clear kung saan magkakaroon ng isang baka. Sa itaas nito, ang isang dayuhan na UFO ay magpapasada sa hangin. Kakailanganin mong i-shoot siya kasama ang iyong mga kanyon. Upang maputok ng sandata ang isang pagbaril, kakailanganin mong malutas ang isang tiyak na equation sa matematika na lilitaw sa harap mo sa screen. Matapos pamilyar ang iyong sarili sa equation gamit ang isang espesyal na numeric panel, kakailanganin mong i-type ang sagot. Kung ito ay ibinigay nang tama, magpapaputok ka ng kanyon at babarilin ang UFO.