Ito ay naging isang mahusay na tradisyon para sa mga sobrang bayani mula sa Marvel uniberso upang lumabas nang mag-isa laban sa isang hukbo ng mga halimaw. Sa Batman Commander, tutulungan mo si Batman na maitaboy ang mga atake ng mga halimaw mula sa kalawakan. Tunay na hindi kasiya-siyang mga nilalang, katulad ng mga kamangha-manghang mga goblin, ay aatake pareho mula sa hangin at mula sa lupa. Upang hindi maging isang madaling target, ang bayani ay gumagalaw sa lahat ng oras, iyon ay, upang tumakbo. Sa pagtakbo, kailangan mong kunan ng larawan ang mga kaaway na gumagalaw patungo o umaatake mula sa itaas. Kinakailangan sa iyo ang kabagabasan at kagalingan ng kamay. Ang gawain ay upang makuha ang maximum na bilang ng mga puntos. Ang bayani ay may tatlong buhay, ang kanilang bilang ay makikita sa kanang sulok sa itaas. Kapag nahaharap sa isang kaaway, isang buhay ang nawala sa Batman Commander.
