Ang isang pangkat ng mga cube ng magkakaibang kulay na naglalakbay sa buong mundo ay nahulog sa isang bitag. Ang mga bayani ay natagpuan ang kanilang mga sarili sa isang piitan at sa laro Zero Squares kakailanganin mong tulungan silang makalabas dito. Bago ka sa screen makikita mo ang silid kung saan matatagpuan ang iyong kubo. Maaari mong gamitin ang mga control key upang makontrol ang mga pagkilos nito. Sa isang lugar sa silid makikita mo ang isang portal na humahantong sa susunod na antas ng laro. Kakailanganin mong kunin ang kubo kasama ang isang tiyak na ruta at gawin ito upang makapasok ito sa portal. Sa iyong paraan, maaaring may mga hadlang na ang iyong character ay kailangang i-bypass.
