Si Ben ay may isang seryosong problema - ang Omnitrix ay inagaw, at nang wala siya ang laban sa mga dayuhan ay itinuturing na nawala. Gayunpaman, tinulungan ng mga kaibigan ang bayani na alamin kung nasaan ang kanyang natatanging aparato at ngayon sa Ben 10 Super Run Fast kailangan niyang magmadali sa buong lungsod upang makuha ito. At ang mga dayuhan ay lumitaw na at ang mga ito ay parang mga balangkas na lumalabas mula sa lupa upang mahuli ang isang tao at i-drag sila palayo sa kanila. Tulungan si Ben, tatakbo siya, at kailangan mong mag-click sa kanya tuwing kailangan mong tumalon. Kolektahin ang iba't ibang mga kapaki-pakinabang na item, gadget at bonus sa Ben 10 Super Run Fast upang gawing mas madali ang gawain habang nagiging mahirap ang kalsada.
