Ang isang nilalang na nagngangalang Pixelmon ay nakatira sa mundo ng Minecraft. Sa paanuman ang aming bayani ay nagpunta sa pinakalayong mga rehiyon ng bansa upang manirahan dito at magtayo ng isang maliit na bayan. Ikaw sa larong Pixelmon Craft ay tutulong sa kanya dito. Sa harap mo sa screen makikita mo ang iyong character, na nasa isang tiyak na lokasyon. Sa gilid nito, isang maliit na mapa ang makikita ng mga icon na nagsasaad ng lokasyon ng iba't ibang mga mapagkukunan. Ang iyong bayani ay kailangang bisitahin ang lahat ng mga lugar na ito at makuha ang mga mapagkukunang ito. Pagkatapos, gamit ang isang espesyal na control panel, sisimulan mo ang pagtatayo ng iba't ibang mga gusali para sa mga pangangailangan ng aming bayani. Maaari ka ring lumikha ng mga bagong tool at sandata.
