Sa panahon ng paglitaw ng Covid, ang populasyon ng planeta ay nagsimulang frantically labanan ang mga virus, karera upang lumikha ng mga bagong bakuna. Gayunpaman, sa panahon ng takot na karera, marami ang nakalimutan na hindi lahat ng mga virus ay napakasasama. Marami sa mga ito ay lubhang kapaki-pakinabang at hindi mabubuhay ang ating katawan nang wala sila. Sa The Flappy Virus, makakatulong ka sa isang kapaki-pakinabang na virus upang makatakas sa mga mapanganib na pagbaril sa bakuna. Nakamamatay sila para sa kanya, at siya, tulad ng anumang nabubuhay na nilalang, ay nais na mabuhay. Sa pamamagitan ng pag-click sa character, gagawin mo siyang lumipad nang mas mataas at mas mababa. Nasa isang tiyak na antas iyon. Lumibot sa mga matutulis na laro ng syringe, hindi sila lumalabas hindi lamang mula sa ibaba ngunit pati na rin mula sa itaas sa The Flappy Virus.
