Sumiklab ang giyera sa pagitan ng dalawang order ng ninja. Ikaw sa laro Ninja Versus Ninja ay makikilahok sa paghaharap na ito. Sa simula ng laro, kailangan mong piliin ang iyong karakter. Sa ilalim nito bibigyan ka ng sandata at bala. Pagkatapos nito, ang iyong bayani ay nasa isang tiyak na lugar. Ang iyong kalaban ay nasa tapat ng dulo ng lokasyon. Sa signal, kakailanganin mong lumipat sa kanyang direksyon. Sa lalong madaling malapit ka, nagsisimula ang tunggalian. Maaari kang mag-welga gamit ang iyong tabak o gumamit ng paghagis ng mga sandata. Ang iyong gawain ay upang patayin ang kaaway nang mabilis hangga't maaari at makakuha ng mga puntos para dito. Aatakihin ka rin niya. Kailangan mong maiwasan ang kanyang mga suntok o harangan ang mga ito sa iyong tabak.
