Kasama ang bayani ng laro Ninja Warrior Adventure, bibisitahin mo ang tatlong mundo: bulkan, disyerto at maniyebe. Ang aming karakter ay isang ninja na nagngangalang Takashi at hindi mahalaga sa kanya kung saan gaganapin ang kanyang kabayanihan. Nais niyang sirain ang lahat ng mga halimaw at kontrabida na maaaring magbanta sa kanyang pamilya. Ang bawat mundo ay may labing limang mga antas. Nangangahulugan ito na naghihintay sa iyo ang isang mahaba at kapanapanabik na pakikipagsapalaran. Ang bayani ay hindi balak na maglakad sa isang lakad, siya ay tatakbo nang mabilis. Sa parehong oras, maaaring hindi niya napansin at mahulog sa isang butas. Samakatuwid, tulungan siya at pindutin ang naaangkop na mga susi upang siya ay tumalon. Kolektahin ang mga kakaibang prutas at gulay upang mai-refresh ang iyong sarili, maaari ka ring tumalon sa mga halimaw, kung saan namatay sila sa Ninja Warrior Adventure. Ang mga control key ay iginuhit sa ibabang kaliwa at kanang sulok.
