Napagpasyahan ng sampung taong gulang na si Ben na bisitahin ang Super Mario sa Super Ben 10, ngunit biglang na-trap. Ang tubero ay walang oras upang makilala ang panauhin at siya, sa pamamagitan ng pagkawalang-galaw, ay nagpunta sa isang espesyal na lugar kung saan ang lahat ng mga bagong dating ay nasubok. Ang mundo ng Mario ay hindi gaanong simple at hindi ligtas, hindi lahat ay maaaring makasama rito. Samakatuwid, kailangan mong pumasa sa pagsubok. Ang mga hindi nakapasa dito ay umuuwi. Si Ben ay dapat na lumipas nang walang mga pagsubok, ngunit aba, at ngayon kailangan mo siyang tulungan sa larong Super Ben 10 upang maipasa ang mga ito nang may dignidad. Ang gawain ay upang kolektahin ang lahat ng mga kabute na may berdeng mga takip at pagkatapos lamang lilitaw ang exit sa susunod na antas. Mayroong tatlumpung mga antas sa Super Ben 10 sa kabuuan, at lalo silang nahihirapan sa bawat oras.
