Ang SpongeBob kasama ang kanyang mga kaibigan ay nagpunta sa isang pagbisita sa kaharian sa ilalim ng tubig. Dito nais nilang makilahok sa isang paligsahan sa chess. Sa Bikini Bottom Chess tutulungan mo ang SpongeBob na manalo ito. Ang isang chessboard ay lilitaw sa screen sa patlang ng paglalaro kung saan magkakaroon ng mga puti at itim na piraso. Idinisenyo ang mga ito bilang iba't ibang mga nilalang sa dagat. Ang bawat piraso ay maaari lamang ilipat ayon sa ilang mga patakaran. Maaari mong pamilyarin ang iyong sarili sa kanila sa pamamagitan ng pagbabasa ng mga espesyal na tagubilin sa simula ng laro. Magsisimula na ang laro. Ang iyong gawain ay upang gumawa ng mga gumagalaw at sirain ang mga piraso ng kalaban upang subukang ilagay ang kanyang hari sa checkmate. Kung magtagumpay ka, mananalo ka sa laro.